吴亚军1964年出生于重庆合川，1984年7月毕业于西北工业大学航海学院，曾从事过机械工程师、记者、编辑等工作。1984年从西北工业大学导航工程系毕业，并在重庆一家国营仪表厂度过了其后的4年。1988年，工科出身的她成为一家名不见经传的行业报纸的记者，6年后创办了自己的公司并开始涉足房地产业。 她曾历任重庆龙湖地产(龙湖·时代天街 龙湖·香醍溪岸)总经理、董事长，2005年9月内部机构改组成立龙湖集团，辞去兼任的所有区域公司总经理之职，任集团董事长兼总经理。

吴女士担任全国人民代表大会代表、重庆市工商联副会长及重庆市总商会房地产商会副会长。吴女士于物业开发，物业投资及物业管理方面拥有丰富经验。 2011年被评为最具风险控制能力的多业态领军企业”; 2010年被评为最具成长性的标杆企业。集团总部设在北京，现有员工4000多人，业务领域涉及地产开发、商业运营和物业服务三大板块。公司于2009年11月19日在香港联交所主板挂牌上市。

2012年10月20日发布的《2012胡润全球白手起家女富豪榜》和《2012胡润女富豪榜》中，吴亚军再次成为全球白手起家的女首富。

2012年10月29日，国内足球媒体报道吴亚军将收购重庆FC队征战中甲联赛进军足坛。重庆妹儿要与足坛房地产大腕较较劲，展示重庆范儿。